Informations générales
La réunion finale de l'ANR Biotempo se déroulera à Rennes les 2 et 3 juin, au centre Inria de Rennes (salle Markov).
Le 2 au soir, invitation au restaurant "la réserve".
Visioconférence: Ressources : IP : 192.134.164.26, Numéro : 300, PIN : A DEMANDER aux organisateurs.
Programme des journées.
2 juin : modèles continus et stochastiques.
- 9h30 : accueil des participants.
- 10h. Anne Siegel. Panorama sur Biotempo (présentation faite à l'ANR en février). [WP1]
- 11h. Patrick Cormier. Ce qu'on a appris sur les oursins. [WP4, WP6c]
- 11h45. Vincent Picard. Ce qu'on pourrait apprendre de plus à l'aide de modèles stochastiques [WP4]
- 12h30: buffet et café.
- 14h. Ovidiu Radulescu. Réduction tropicale. Implémentation, Applications au TGFbeta ? [WP5]
- 15h30. Vincent Picard. Corrélations et modèle TGF beta (à confirmer) [WP4, WP6b]
- 16h: pause
- 16h30: Discussions croisées. Quelles continuations ? (titres à modifier, liste d'intervenants ouverte)
- Ovidiu Radulescu. application des réductions tropicales ? Nouveaux problèmes mathématiques?
- Jérémie Bourdon. Quels invariants dans les familles de modèles probabilistes ?
- Francois Fages. Quels invariants dans les familles de modèles statiques ?
- Robert Bellé. Nouvelles questions autour de l'oursin?
- Nathalie Théret. Lien avec kappa ? Suites à donner pour le TGFbeta ?
3 juin : modèles discrets.
- 9h00: accueil.
- 9h15. Philippe Bordron. Identification de régulateurs chez Ferroxidans. Alignements de réseaux métaboliques et de génomes. [WP2]
- 10h. Eléments de discussions/prospectives.
- Anne Siegel, Syvlain Prigent, Guillaume Collet. Introduction de nouvelles connaissances: métabolisme, orthologie, sémantique des réactions ? Comment introduire des données plus quantitatives et fonctionnelles ?
- Damien Eveillard, Jérémie Bourdon, H. Larhlimi. Modélisation des écosystèmes. Applications aux bactéries minières.
- 10h40. Pause café.
- 11h. Santiago Videla. Apprentissage et contrôle de modèles logique pour les réseaux de signalisation. [WP2,WP3]
- 11h40. Loic Paulevé. Analyses de causalité et process hitting. [WP3, WP6a]
- 12h20. buffet.
- 13h40. Geoffroy Andrieux. Etudes des trajectoires du TGFbeta. [WP3, WP6a]
- 14h20. Maxime Folschette. Introduction de données temporelles dans le PH à l'aide de priorités. [WP2, WP3]
- 15h. Julien Gras. Mobyle Biotempo.
- 15h30. Pause.
- 16h. Eléments de discussion/prospectives (titres à modifier, liste d'intervenants ouverte)
- Carito Guziolowski. Validations expérimentales des réseaux ?
- Loic Paulevé, Santiago Videla, Carito Guziolowski. Apprendre à partir de données temporelles : combiner ASP et process hitting ?
- Nathalie Théret, Olivier Dameron (?). Que dire au sujet du TGFbeta ? Etude sémantique des trajectoires ?
- Olivier Roux, Jérémie Bourdon Liens entre POGG et PINT ?
- 17h30. FIn
Liste des participants doodle
- R. Bellé
- O. Radulescu
- P. Bordron
- J. Bourdon
- J. Gras
- L. Paulevé
- O. Roux
- D. Eveillard
- G. Collet
- S. Videla
- V. Picard
- N. Theret
- A. Richard
- M. Folschette
- C. Guziolowski
- V. Delannée
- A. Larhlimi
- S. Prigent
- P. Cormier
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